상호운용성검증실에서는 센터 내 도입되는 정보시스템의 통합 촉진 및 이기종 시스템 간 상호연계를 위해 서버, 스토리지, 백업 장비에 대한 기술검토 및 시험검증을 시행한다.
향후 센터에 정보시스템을 납품하고자 하는 제조사 및 제품 공급사는 센터장이 실시하는 상호운용성검증시험을 통과한 제품만 도입될수 있다. IOT 신청방법 및 절차에 대한 자세한 내용은 "정부통합전산센터 홈페이지(http://www.ncia.go.kr) → 공지사항 → 정보시스템 상호운용성 지침"을 참조하면 된다.